Generación mediante CRISPR/Cas9 de células de glioblastoma editadas en un elemento de regulación génica activado por la demetilasa de histonas LSD1: análisis de expresión génica

Abstract

[spa] El glioblastoma (GBM) es el principal tipo de tumor cerebral primario y está asociado con una gran agresividad clínica y una tasa de supervivencia muy baja. Un promotedor campo de estudio para futuros tratamientos es la epigenética, ya que nuevas evidencias sugieren que los cambios epigenéticos tienen un papel importante en la aparición y progresión de este tipo de tumores incurables. La Lisina Demetilasa-1 Específica de Histonas (LSD1), la cual promueve cambios en las histonas, parece estar relacionada en diferentes tipos de tumores como los GBMs. En este estudio, se han obtenido células de GBM editadas mediante CRISPR/Cas9 en una región del genoma en la que se une LSD1 con el objetivo de estudiar el posible impacto de esta alteración en la expresión de tres genes próximos a dicha región: PDGFRA, CHIC2 y GSX2, todos ellos relacionados con los GBMs. Los resultados indican que no hay cambios significativos en cuanto a la expresión de PDGFRA y GSX2, en cambio sí para CHIC2 con una reducción del 10% respecto al grupo control. No obstante, no se puede aceptar completamente este resultado puesto que la segunda comprobación de la transfección fue algo ambigua y requeriría una repetición de la prueba. Además, el cambio en la expresión de CHIC2 es significativo por la baja variabilidad en los replicados, que son técnicos y no biológicos.

[eng] Glioblastoma (GBM) is the main type of brain primary tumor and is associated with big clinical agressivity and a poor survival rate. A promising field for the future of GBM treatments is epigenetics, because new evidence suggest that epigenetic changes have a big role in the appearence and progression of this type of incurable tumors. Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1), which promotes changes in histones, has been found to be involved in different types of tumors like GBM. In this study, we obteined LN229 modified cells using the CRISPR/Cas9 technology to invalidated a region of the DNA where LSD1 binds, with the aim to study the effects of this change on the expression of genes revolving that area (PDGFRA, CHIC2, GSX2), all of them related to GBM progression. Results show there are no significant changes on the expression of PDGRFA and GSX2, but CHIC2 is down-regulated in transfected cells by 10%. However, it is not possible to completely accept these results because the second comprobation of the transfection was ambiguous and it needed a repetition of the experiment. Further, the change on CHIC2 expression being significant is also a result of the small variability of the samples, which were theoretical replicates, not biological