Análisis de secuencias multilocus en estudios de taxonomía, filogenia y evolución de Pseudomonas

Abstract

[spa] El género Pseudomonas comprende muchas especies de interés ambiental, clínico, agrícola o biotecnológico. A pesar de estar bien definido desde los puntos de vista fenotípico y genotípico se están describiendo continuamente nuevas especies dentro del género. La enorme diversidad genética de algunas de las especies del género está claramente demostrada, como sucede en P. stutzeri y hay que ver cómo se manifiesta en otras especies del género. El método actualmente aceptado para discriminar entre especies bacterianas es la hibridación DNA-DNA, pero este método tiene sus limitaciones (tiempo requerido, necesidad de experiencia en desarrollo, no define distancias entre especies, no es acumulativo). En este proyecto proponemos el desarrollo de un nuevo método, fiable y acumulativo para la definición de especies en el género Pseudomonas, basado en la técnica de tipado multilocus de secuencias (MLST). La enorme diversidad genética de las especies de este género ha hacen un banco de pruebas ideal en el que se pueden validar nuevos métodos. La técnica de MLST permitirá además elucidar la diversidad genética del género, su filogenia y su taxonomía. Para ello habrá que aplicar nuevas herramientas bioinformáticas. Además, el conjunto de datos debe ser accesible a través de Internet y, para que sea útil a la comunidad científica, debe ir acompañado de una buena colección de microorganismos que aseguren el material biológico necesario para estudios comparativos.