Revisión de la taxonomía del género Pseudomonas basada en un análisis filogenómico y multigénico

Abstract

[spa] En este trabajo se presenta un estudio comparativo in silico de la filogenia de 217 cepas tipo del género Pseudomonas basado en el análisis de los genomas secuenciados a fecha del 4 de febrero del 2020, junto con otros genomas correspondientes a especies de géneros próximos filogenéticamente relacionados. Se han comparado las relaciones filogenéticas obtenidas a partir del (i) análisis MLSA empleado rutinariamente para este género (16S rRNA, gyrB, rpoB, rpoD), (ii) a partir de un concatenado de 120 genes descritos en el estudio de Parks y colaboradores; y (iii) a partir de comparaciones por parejas de las identidades nucleotídicas promedio basadas en el algoritmo BLAST (ANIb). Los resultados obtenidos han permitido revisar la filogenia de este género apoyando la escisión de este género en distintos géneros.