Caracterització molecular basada en seqüències d'ADN de la microbiota intestinal d'amfípodes estigobionts del gènere haploginglymus

Abstract

[cat] El gènere Haploginglymus pertany a la família de crustacis amfípodes d’aigua dolça Niphargidae. Es tracta d’un gènere estrictament aquàtic subterrani (estigobiont) endèmic de la Península Ibèrica amb biologia i història evolutiva força desconegudes. Conèixer la composició de la seva microbiota podria ser clau per entendre aspectes de la seva biologia i de la seva evolució. Al present Treball de Fi de Grau es posa a punt una metodologia basada en la tècnica coneguda com a DNA barcoding per a identificar basant-se en les seves seqüències del gen 16S els bacteris de la microbiota de dos exemplars representatius de dues espècies d’Haploginglymus. Els resultats obtinguts han permès identificar Spiroplasma platyhelix, bacteris del gènere Curvibacter i de l’ordre Hypomicrobiales (alfa-proteobacteris) com a bacteris presents en la microbiota d’Haploginglymus. Es conclou que el mètode és útil per realitzar una caracterització detallada de la microbiota d’aquest enigmàtic grup de crustacis.

[spa] El género Haploginglymus pertenece a la familia de crustáceos anfípodos de agua dulce Niphargidae. Se trata de un género estrictamente acuático subterráneo (estigobionte) endémico de la Península Ibérica con biología e historia evolutiva bastante desconocidas. Conocer la composición de su microbiota podría ser clave para entender aspectos de su biología y de su evolución. En el presente Trabajo de Fin de Grado se pone a punto una metodología basada en la técnica conocida como DNA barcoding para identificar basándose en sus secuencias del gen 16S las bacterias de la microbiota de dos ejemplares representativos de dos especies de Haploginglymus. Los resultados obtenidos han permitido identificar Spiroplasma platyhelix, bacterias del género Curvibacter y del orden Hypomicrobiales (alfa-proteobacterias) como bacterias presentes en la microbiota de Haploginglymus. Se concluye que el método es útil para realizar una caracterización detallada de la microbiota de este enigmático grupo de crustáceos.

[eng] The genus Haploginglymus belongs to the family of freshwater amphipod crustaceans Niphargidae. It is a strictly aquatic subterranean (stigbiont) genus endemic to the Iberian Peninsula, with largely unknown biology and evolutionary history. Knowing the composition of his microbiota could be key to understanding aspects of his biology and evolution. The current Final Degree Project develops a technique-based methodology known as DNA barcoding to identify microbiota bacteria from two species of Haploginglymus based on their 16S gene sequences. The results have identified Spiroplasma platyhelix, bacteria of the genus Curvibacter and the order Hypomicrobiales (alpha-proteobacteria) as bacteria present in the microbiota of Haploginglymus. It is concluded that the method is useful for performing a detailed characterization of the microbiota of this enigmatic group of crustaceans.