Ensamblaje, anotación y descripción del genoma mitocondrial del crustáceo subterráneo endémico de Baleares Typhlocirolana Moraguesi a partir de datos de secuenciación masiva

Abstract

[eng] Typhlocirolana moraguesi is an omnivorous isopod crustacean that belongs to the Cirolanidae family that inhabits subterranean cave environments. Here we use a sample collected in Mallorca Island to conduct a series of investigations regarding its genetics, not much studied until the present work. We have sequenced the complete mitochondrial genome of the organism by using state-of-the-art massive sequencing techniques (NGS) based on Illumina technology. Thanks to these high-quality techniques, the complete mitogenome has been assembled, annotated, and finally described. The result was a detailed study on the mitochondrial DNA of T. moraguesi, including the verification of the thirteen protein-coding genes, the twenty-two tRNA secondary structures and, in addition, a phylogenetic analysis to shed light on the systematic position of this crustacean species endemic to the Balearic Islands.

[spa] El crustáceo conocido como Typhlocirolana moraguesi es un isópodo omnívoro perteneciente a la familia de Cirolanidae que habita en ambientes cavernícolas subterráneos. A partir de una muestra recolectada en la isla de Mallorca, han sido llevadas a cabo toda una serie de indagaciones en cuanto a su genética, no muy estudiada hasta el presente trabajo. Concretamente, se ha procedido a la secuenciación del genoma mitocondrial completo del organismo objeto de estudio mediante el uso de técnicas de secuenciación masiva (NGS) con tecnología Illumina, una de las más vanguardistas en la actualidad. Gracias a estas técnicas de alta calidad, el mitogenoma completo ha podido ser ensamblado, anotado y finalmente descrito. El resultado ha sido el estudio detallado del ADN mitocondrial de T. moraguesi, lo cual incluye la verificación de los trece genes que codifican para proteínas, de las veintidós estructuras tRNAs y, además, también ha podido realizarse un análisis filogenético. A partir de este último, se ha podido constatar la posición filogenética del crustáceo endémico de las Islas Baleares.