Utilización de herramientas de acceso libre aplicadas al análisis de datos de un estudio de transcriptómica en células tratadas con un mimético del MIR-200B

Abstract

[spa] Los avances en el desarrollo de nuevas técnicas ómicas y herramientas computacionales e informáticas han permitido descubrir el papel de los miARNs como biomarcadores en muchas enfermedades. Los miARNs regulan la expresión genética mediante la represión de la traducción del ARNm o su degradación. Hay muchos estudios que se han enfocado en caracterizar el perfil de los miARN en el tejido adiposo de pacientes con obesidad ya que es una de las enfermedades con más incidencia a nivel mundial. Gracias a dichas investigaciones, además, se ha descubierto que la leche materna, la cual tiene una alta expresión de miARNs, se ve alterada dependiendo de la dieta de la madre, lo que podría repercutir en la salud del bebé. Por ejemplo, el miR-200b es uno de los miARN que se ven disminuidos en función de la dieta en la leche materna. Por esta razón, en este trabajo se pretende analizar la alteración de la expresión génica en preadipocitos tras ser transfectados con un mimético del miR-200b. Los resultados del análisis transcriptómico revelan, aunque no de forma significativa, que el miR-200b altera el ciclo celular y la replicación y sus vías de reparación. La afectación a nivel tisular no puede estimarse mediante un estudio en preadipocitos, por lo que, sería interesante en un futuro estudiar si la disminución de dicho miARN en ratones tiene algún efecto en el tejido adiposo y la obesidad.

[eng] Advances in the development of new omics techniques and computational and informatics tools have led to the discovery of the role of miRNAs as biomarkers in many diseases. MicroRNAs (miRNAs) regulate gene expression by repressing mRNA translation or degradation. Many studies have focused on characterising the miRNA profile in adipose tissue of patients with obesity, which is one of the most prevalent diseases worldwide. Thanks to this research, it has also been discovered that breast milk, which has a high expression of miRNAs, is altered depending on the mother's diet, which could have repercussions on the baby's health. For example, miR-200b is one of the miRNAs that is decreased depending on the diet in breast milk. For this reason, this work aims to analyse the alteration of gene expression in preadipocytes after transfection with a miR-200b mimetic. The results of the transcriptomic analysis reveal, although not significantly, that miR-200b alters the cell cycle and replication and repair pathways. The effect on tissue level cannot be estimated by means of a study in pre-adipocytes, so it would be interesting in the future to study whether the reduction of this miRNA in mice has any effect on adipose tissue and obesity.

[cat] Els avanços en el desenvolupament de noves tècniques òmiques i eines computacionals i informàtiques han permès descobrir el paper dels miARNs com a biomarcadors en moltes malalties. Els miARNs regulen l'expressió genètica mitjançant la repressió de la traducció de l'ARNm o la seva degradació. Hi ha molts estudis que s'han enfocat a caracteritzar el perfil dels miARN en el teixit adipós de pacients amb obesitat, ja que és una de les malalties amb més incidència a nivell mundial. Gràcies a aquestes investigacions, a més, s'ha descobert que la llet materna, la qual té una alta expressió de miARNs, es veu alterada depenent de la dieta de la mare, cosa que podria repercutir en la salut del nadó. Per exemple, el miR-200b és un dels miARN que es veuen disminuïts en funció de la dieta a la llet materna. Per això, en aquest treball es pretén analitzar l'alteració de l'expressió gènica en preadipòcits després de ser transfectats amb un mimètic del miR-200b. Els resultats de l'anàlisi transcriptòmic revelen, encara que no de manera significativa, que el miR-200b altera el cicle cel·lular i la replicació i les seves vies de reparació. L'afectació a nivell tissular no es pot estimar mitjançant un estudi en preadipòcits, per la qual cosa seria interessant en un futur estudiar si la disminució del miARN en ratolins té algun efecte en el teixit adipós i l'obesitat