Análisis comparativo del pangenoma de nuevos aislamientos de Legionella spp.

Abstract

[spa] Legionella es un género bacteriano de gran importancia y relevancia en el sector sanitario y terciario, ya que anualmente se producen ingresos hospitalarios y pérdidas económicas en esos sectores debido a focos de infección provocados por bacterias de este género. Recientemente, procedentes de la empresa Biolínea.com, tuvieron entrada en el laboratorio del grupo de Microbiología de la Universidad de las Islas Baleares (UIB) dos nuevos aislados (IQP-15 y MOS-30) pertenecientes a este género para su caracterización fenotípica y molecular. Las primeras pruebas moleculares indicaban que ambos aislamientos no se correspondían con ninguna de las especies existentes en la actualidad. El principal objetivo de este trabajo fue obtener un contexto filogenético, pangenómico y taxonómico de los dos aislados IQP-15 y MOS-30. Para ello, a partir de las lecturas del genoma, previamente generadas, se probaron varios ensambladores y diferentes condiciones de ensamblaje, el mejor ensamblaje obtenido se anotó mediante Prokka y finalmente se realizaron los análisis comparativos basados en varios niveles de complejidad utilizando tres genes con diferentes niveles de especifidad y conservación evolutiva 1) gen ARN ribosómico 16S, 2) rpoD, 3) mip; y análisis pangenómico. Todos los análisis se realizaron utilizando los genes y genomas de las respectivas cepas tipo obtenidos del GenBank. Los resultados pusieron de manifiesto la proximidad entre el aislado IQP-15 con Legionella drozanskii LLAP-1 y Legionella feeleii ATCC-35072, mientras que el aislados MOS-30 se relacionó con Legionella fallonii LLAP-10. Aunque los resultados bioinformáticos apoyan la idea de que ambos aislamientos IQP- 15 y MOS-30 representan dos especies nuevas dentro del género, aún faltaría la realización de pruebas fenotípicas para su completa descripción y propuesta como nuevas especies dentro del género Legionella.