Técnicas de cultivo y moleculares para el estudio de las comunidades microbianas en aguas hospitalarias

Abstract

[spa] La calidad microbiológica de las aguas es de crucial importancia en el tratamiento sustitutivo renal de los pacientes sometidos a hemodiálisis. Las aguas de hemodiálisis utilizadas para la preparación del líquido de hemodiálisis constituyen un hábitat oligotrófico en el que pueden desarrollarse comunidades bacterianas complejas, con un elevado índice de diversidad procariota. Los microorganismos presentes en las aguas pueden formar biopelículas sobre los filtros, depósitos y conducciones de agua lo que dificulta su eliminación y facilita su persistencia. Algunas de estas bacterias son potencialmente patógenas y pueden ser el origen de infecciones nosocomiales o actuar como reservorio y medio de difusión de genes de resistencia a antibióticos. Además, algunos productos microbianos resultantes de la muerte y lisis microbiana, así como las “nanobacterias”, pueden atravesar los filtros de hemodiálisis, provocando reacciones inflamatorias en los pacientes con insuficiencia renal crónica. La presente tesis doctoral pretende ampliar nuestros conocimientos sobre las bacterias constituyentes de estas biopelículas en las aguas de hemodiálisis, utilizando metodologías moleculares de nueva generación, así como nuevas estrategias de identificación de aislados bacterianos. El fin último es el conocimiento de las bacterias implicadas, así como el de las condiciones que favorecen su desarrollo, lo que permitirá establecer metodologías para su seguimiento y eliminación, consiguiendo unas aguas de hemodiálisis de mejor calidad y contribuyendo a la calidad de vida de las personas sometidas a este tratamiento

[cat] La qualitat microbiològica de les aigües de diàlisis es molt important en el tractament substitutiu renal dels malalts sotmesos a hemodiàlisis. Les aigües d’hemodiàlisis utilitzades per la preparació del líquid d’hemodiàlisis constitueixen un habitat oligotròfic on es poden desenvolupar comunitats bacterianes complexes, amb un alt nombre de diversitat procariota. Els microorganismes presents a aquestes aigües poden formar biopel·lícules damunt els filtres, depòsits i conduccions d’aigua, dificultant la seva eliminació i facilitant la seva persistència. Alguns d’aquests bacteris son potencialment patògens i poden ser l’origen d’infeccions nosocomials o actuar com a reservoris i medi de difusió de gens de resistència a antibiòtics. A més, alguns productes microbians conseqüència de la mort i lisi microbiana, provoquen reaccions inflamatòries als malalts amb insuficiència renal crònica. Aquesta tesis doctoral pretén ampliar els nostres coneixements sobre els bacteris que formen les biopel·lícules a les aigües d’hemodiàlisis, utilitzant metodologies moleculars de nova generació, així com noves estratègies d’identificació dels aïllats bacterians. Es pretén el coneixement dels bacteris implicats, així com de les condicions que afavoreixen el seu desenvolupament, permetent establir metodologies per el seu seguiment i eliminació, i aconseguir aigües d’hemodiàlisis de millor qualitat, contribuint a la qualitat de vida de les persones sotmeses a aquest tractament.

[eng] The microbiological quality of water is of crucial importance in the renal replacement therapy of patients undergoing haemodialysis. The water used to prepare haemodialysis fluid constitutes an oligotrophic habitat in which complex bacterial communities with a high level of diversity can develop. The microorganisms present in water can form biofilms on filters, tanks and water pipes which hinders their elimination and facilitates persistence. Some of these bacteria are potentially pathogenic, may be the source of nosocomial infections, and act as a reservoir and medium for the dissemination of antibiotic resistance genes. In addition, some microbial products resulting from the lyses and death of microorganisms, as well as "nanobacteria", can pass through the haemodialysis filters, causing inflammatory reactions in patients with chronic renal failure. The aim of this doctoral thesis is to expand our knowledge of the constituents of these biofilm bacteria in the waters of haemodialysis, using next-generation sequencing methodologies and new strategies for identifying bacterial isolates. The ultimate goal is the knowledge of the bacteria involved and the conditions that favour its development which will allow the establishment of methodologies for monitoring them and their removal, getting a better haemodialysis water quality and contributing to the quality of life of persons subject to this treatment.